Protein–RNA interactions for Protein: Q96BY7

ATG2B, Autophagy-related protein 2 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 2,078 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG2BQ96BY7 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ATG2BQ96BY7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ATG2BQ96BY7 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms