Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSC1Q92574 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSC1Q92574 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms