Protein–RNA interactions for Protein: Q15059

BRD3, Bromodomain-containing protein 3, humanhuman

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRD3Q15059 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
BRD3Q15059 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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BRD3Q15059 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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BRD3Q15059 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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BRD3Q15059 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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BRD3Q15059 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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BRD3Q15059 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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BRD3Q15059 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
BRD3Q15059 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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