Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTGDRQ13258 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PTGDRQ13258 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms