Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 EXOC4-217ENST00000483800 559 ntTSL 46.98□□□□□ -1.297e-7■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 EXOC4-216ENST00000482089 628 ntTSL 46.98□□□□□ -1.297e-7■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 ZCCHC7-206ENST00000488607 884 ntTSL 26.18□□□□□ -1.427e-7■■■■□ 24.9
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TARDBPQ13148 IVNS1ABP-204ENST00000459929 3657 ntTSL 512.07□□□□□ -0.484e-9■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 IVNS1ABP-206ENST00000475046 1816 ntTSL 25.24□□□□□ -1.574e-9■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 IVNS1ABP-207ENST00000480769 3776 ntTSL 1 (best)3.5□□□□□ -1.854e-9■■■■□ 24.9
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TARDBPQ13148 AFF1-203ENST00000503369 598 ntTSL 25.94□□□□□ -1.463e-7■■■■□ 24.9
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TARDBPQ13148 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.734e-7■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■■■□ 24.9
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TARDBPQ13148 CORO7-PAM16-202ENST00000572467 3284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.452e-6■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 MPP1-211ENST00000471821 558 ntTSL 214.81□□□□□ -0.042e-6■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 MPP1-201ENST00000369531 519 ntTSL 312.3□□□□□ -0.442e-6■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PAK4-210ENST00000599657 534 ntTSL 418.89■□□□□ 0.612e-6■■■■□ 24.9
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TARDBPQ13148 PARD3B-201ENST00000349953 3315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.653e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 PARD3B-203ENST00000358768 3432 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.783e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 TGIF2-208ENST00000611732 3344 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.39□□□□□ -0.913e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 RAB40B-210ENST00000576148 343 ntTSL 37.97□□□□□ -1.133e-7■■■■□ 24.8
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TARDBPQ13148 STRN3-206ENST00000555152 567 ntTSL 45.87□□□□□ -1.473e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 CFDP1-204ENST00000564793 457 ntTSL 35.61□□□□□ -1.513e-7■■■■□ 24.8
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TARDBPQ13148 ADAM10-207ENST00000470269 1693 ntTSL 1 (best)4.42□□□□□ -1.71e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 ADAM10-202ENST00000396136 2418 ntTSL 1 (best)4.21□□□□□ -1.741e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 SLC25A37-207ENST00000520654 3018 ntTSL 1 (best)8.99□□□□□ -0.975e-10■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 MAP4-209ENST00000434267 2772 ntTSL 2 BASIC7.37□□□□□ -1.235e-7■■■■□ 24.8
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TARDBPQ13148 LRP8-212ENST00000529670 660 ntTSL 55.12□□□□□ -1.599e-11■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 GAK-221ENST00000515868 3903 ntTSL 211.74□□□□□ -0.533e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.199e-10■■■■□ 24.8
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TARDBPQ13148 AC139493.2-201ENST00000508056 1612 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 AC139493.2-203ENST00000512260 534 ntTSL 47.95□□□□□ -1.141e-6■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 AC139491.2-201ENST00000515403 3632 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 RAPGEF2-204ENST00000504604 693 ntTSL 58.91□□□□□ -0.985e-7■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.673e-6■■■■□ 24.8
TARDBPQ13148 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.011e-12■■■■□ 24.7
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