Protein–RNA interactions for Protein: Q06787

FMR1, Synaptic functional regulator FMR1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMR1Q06787 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.469e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.469e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CABIN1-205ENST00000445422 1472 ntTSL 223.84■■□□□ 1.419e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 EPHB4-207ENST00000489808 921 ntTSL 1 (best)23.83■■□□□ 1.419e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PHF20-207ENST00000461122 919 ntTSL 323.79■■□□□ 1.49e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.392e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KANK2-212ENST00000592675 624 ntTSL 523.74■■□□□ 1.399e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-207ENST00000572974 495 ntTSL 422.88■■□□□ 1.259e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC22.73■■□□□ 1.239e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.229e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 LRCH1-204ENST00000443945 2070 ntTSL 1 (best)22.43■■□□□ 1.181e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-213ENST00000576911 1413 ntTSL 222.32■■□□□ 1.169e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.139e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KRT8-210ENST00000548998 918 ntTSL 522.11■■□□□ 1.131e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DMTF1-214ENST00000434534 581 ntTSL 422.03■■□□□ 1.129e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CDC45-204ENST00000428937 577 ntTSL 522.01■■□□□ 1.119e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KRT8-204ENST00000546826 1165 ntTSL 521.98■■□□□ 1.111e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.119e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NSD1-210ENST00000510954 533 ntTSL 221.86■■□□□ 1.099e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.089e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.061e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.059e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-204ENST00000417206 581 ntTSL 421.49■■□□□ 1.039e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 19e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 19e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.999e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.989e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.979e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.971e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.949e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 520.69■□□□□ 0.92e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DMTF1-237ENST00000584457 569 ntTSL 420.66■□□□□ 0.99e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.889e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 EPHB4-209ENST00000492878 769 ntTSL 520.54■□□□□ 0.889e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KANK2-209ENST00000590400 1812 ntTSL 1 (best)20.43■□□□□ 0.869e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.869e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.849e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 EPHB4-204ENST00000477446 1551 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.819e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.89e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-212ENST00000437722 544 ntTSL 319.91■□□□□ 0.789e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DMTF1-226ENST00000579592 579 ntTSL 419.9■□□□□ 0.789e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.779e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.739e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CDC45-210ENST00000487669 736 ntTSL 319.55■□□□□ 0.729e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HAUS8-207ENST00000598517 1055 ntTSL 519.41■□□□□ 0.79e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.689e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.679e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.679e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.669e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.649e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.639e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.629e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.621e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.619e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-208ENST00000431124 920 ntTSL 518.86■□□□□ 0.612e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.61e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.69e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.552e-15■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-209ENST00000424709 437 ntTSL 318.4■□□□□ 0.549e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.549e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 AKAP1-217ENST00000576295 614 ntTSL 318.38■□□□□ 0.539e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.489e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.479e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PHF20-206ENST00000452270 832 ntTSL 517.94■□□□□ 0.469e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.469e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.451e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ACIN1-219ENST00000556052 746 ntTSL 217.69■□□□□ 0.429e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.429e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 AP1B1-206ENST00000415756 519 ntTSL 317.63■□□□□ 0.419e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.411e-10■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-207ENST00000419541 466 ntTSL 317.6■□□□□ 0.419e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 VGLL4-215ENST00000458499 766 ntTSL 317.6■□□□□ 0.419e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.419e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.49e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.49e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.399e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.389e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.389e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.359e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CBFA2T3-210ENST00000569464 1327 ntTSL 1 (best)17.25■□□□□ 0.359e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ACIN1-216ENST00000555478 1017 ntTSL 517.14■□□□□ 0.339e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.329e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.319e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.319e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 CHAF1A-204ENST00000587368 564 ntTSL 516.93■□□□□ 0.39e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PML-216ENST00000566068 834 ntTSL 316.74■□□□□ 0.279e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ANKLE2-206ENST00000538766 1557 ntTSL 216.68■□□□□ 0.269e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.269e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.259e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.249e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.239e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 RBL1-201ENST00000344359 3225 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.239e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.219e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.219e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 USP5-204ENST00000537267 2522 ntTSL 516.33■□□□□ 0.29e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.29e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 NAP1L1-226ENST00000552342 1526 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.199e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.189e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 ATG2A-202ENST00000418259 5654 ntTSL 516.14■□□□□ 0.179e-6■■■■□ 20.6
FMR1Q06787 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.179e-6■■■■□ 20.6
Retrieved 100 of 13,491 protein–RNA pairs in 89.9 ms