Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
FGD1P98174 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FGD1P98174 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FGD1P98174 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FGD1P98174 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FGD1P98174 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FGD1P98174 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms