Protein–RNA interactions for Protein: P57735

RAB25, Ras-related protein Rab-25, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB25P57735 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RAB25P57735 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RAB25P57735 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RAB25P57735 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RAB25P57735 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RAB25P57735 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms