Protein–RNA interactions for Protein: P50897

PPT1, Palmitoyl-protein thioesterase 1, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPT1P50897 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PPT1P50897 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPT1P50897 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PPT1P50897 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PPT1P50897 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PPT1P50897 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms