Protein–RNA interactions for Protein: P18847

ATF3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF3P18847 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ATF3P18847 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ATF3P18847 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
ATF3P18847 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
ATF3P18847 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ATF3P18847 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ATF3P18847 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ATF3P18847 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms