Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CCL3L1P16619 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms