Protein–RNA interactions for Protein: O95166

GABARAP, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPO95166 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABARAPO95166 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GABARAPO95166 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms