Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
GATCO43716 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
GATCO43716 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GATCO43716 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GATCO43716 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GATCO43716 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
GATCO43716 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms