Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJD0

RIMS3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMS3Q9UJD0 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIMS3Q9UJD0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms