Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SMPXQ9UHP9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms