Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.57
RRP7BPQ9NSQ0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
RRP7BPQ9NSQ0 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
RRP7BPQ9NSQ0 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms