Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCJ6

VAT1L, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog-like, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1LQ9HCJ6 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
VAT1LQ9HCJ6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
VAT1LQ9HCJ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms