Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0K4

RSPH6A, Radial spoke head protein 6 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPH6AQ9H0K4 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
RSPH6AQ9H0K4 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
RSPH6AQ9H0K4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms