Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVM4

GGACT, Gamma-glutamylaminecyclotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGACTQ9BVM4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GGACTQ9BVM4 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
GGACTQ9BVM4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms