Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRX5

GINS3, DNA replication complex GINS protein PSF3, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINS3Q9BRX5 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
GINS3Q9BRX5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
GINS3Q9BRX5 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms