Protein–RNA interactions for Protein: Q96M19

LINC00477, Putative transmembrane protein encoded by LINC00477, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00477Q96M19 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
LINC00477Q96M19 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC00477Q96M19 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms