Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF185Q96GF1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF185Q96GF1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
RNF185Q96GF1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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RNF185Q96GF1 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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RNF185Q96GF1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF185Q96GF1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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RNF185Q96GF1 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF185Q96GF1 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF185Q96GF1 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF185Q96GF1 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
RNF185Q96GF1 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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