Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CEP170Q5SW79 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.63■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
CEP170Q5SW79 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms