Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q56UQ5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q56UQ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Q56UQ5 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Q56UQ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms