Protein–RNA interactions for Protein: Q53FD0

ZC2HC1C, Zinc finger C2HC domain-containing protein 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZC2HC1CQ53FD0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ZC2HC1CQ53FD0 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ZC2HC1CQ53FD0 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms