Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 SGK1-218ENST00000524387 576 ntTSL 42.69□□□□□ -1.981e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 SGK1-225ENST00000531575 576 ntTSL 41.55□□□□□ -2.161e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ASPSCR1-221ENST00000585274 984 ntTSL 516.65■□□□□ 0.263e-10■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ASPSCR1-218ENST00000583744 539 ntTSL 413.93□□□□□ -0.183e-10■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ASPSCR1-206ENST00000578361 590 ntTSL 213.76□□□□□ -0.212e-14■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ASPSCR1-217ENST00000583693 3976 ntTSL 212.4□□□□□ -0.427e-15■■■■■ 37
SF3B4Q15427 ASPSCR1-215ENST00000583142 532 ntTSL 39.69□□□□□ -0.867e-15■■■■■ 37
SF3B4Q15427 RAD9A-202ENST00000529100 1037 ntTSL 311.15□□□□□ -0.629e-7■■■■■ 37
SF3B4Q15427 MAGED2-211ENST00000487482 341 ntTSL 23.03□□□□□ -1.922e-6■■■■■ 37
SF3B4Q15427 RHEB-203ENST00000470370 501 ntTSL 54.44□□□□□ -1.75e-13■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 RECQL5-205ENST00000443199 3089 ntTSL 1 (best)13.54□□□□□ -0.241e-8■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 RECQL5-204ENST00000423245 3576 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.511e-8■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 RECQL5-201ENST00000317905 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.571e-8■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 BCL7A-202ENST00000432926 871 ntTSL 220.69■□□□□ 0.94e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.454e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.414e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 PPP2R3B-207ENST00000477636 519 ntTSL 514.58□□□□□ -0.083e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 MYO1C-215ENST00000574341 541 ntTSL 25.91□□□□□ -1.464e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.664e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.654e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.634e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.574e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-211ENST00000618568 1612 ntTSL 318.41■□□□□ 0.544e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.394e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.214e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.014e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 KIF20A-201ENST00000394894 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.33□□□□□ -1.247e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 KIF20A-205ENST00000508792 2935 ntTSL 2 BASIC5.62□□□□□ -1.517e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-210ENST00000614462 734 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.593e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-206ENST00000545322 491 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.643e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.663e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.793e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-211ENST00000615071 344 ntTSL 23.83□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.83e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.813e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.843e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.595e-9■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 CTSA-217ENST00000607482 403 ntTSL 317.6■□□□□ 0.415e-11■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 CTSA-219ENST00000607841 571 ntTSL 212.93□□□□□ -0.345e-11■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 DIP2A-207ENST00000473752 1638 ntTSL 1 (best)13.37□□□□□ -0.277e-7■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 DDX46-211ENST00000513987 543 ntTSL 36.27□□□□□ -1.412e-8■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 PICALM-222ENST00000534375 390 ntTSL 23.58□□□□□ -1.843e-6■■■■■ 36.9
SF3B4Q15427 KAT6A-204ENST00000418721 3279 ntTSL 28.81□□□□□ -11e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KAT6A-208ENST00000485568 3592 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.79□□□□□ -11e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.121e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KAT6A-202ENST00000396930 9285 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RAE1-208ENST00000492498 1156 ntTSL 515.36■□□□□ 0.052e-8■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RAE1-207ENST00000462438 3251 ntTSL 211.84□□□□□ -0.512e-8■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RAE1-209ENST00000527947 1503 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RAE1-203ENST00000395841 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.762e-8■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RAE1-201ENST00000371242 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.822e-8■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RAE1-202ENST00000395840 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.922e-8■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.731e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KDELR1-201ENST00000330720 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.261e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KDELR1-205ENST00000600980 815 ntTSL 37.98□□□□□ -1.131e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 KDELR1-204ENST00000599084 582 ntTSL 27.7□□□□□ -1.181e-7■■■■■ 36.8
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SF3B4Q15427 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.194e-10■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 PIDD1-204ENST00000525028 3175 ntTSL 1 (best)13.32□□□□□ -0.284e-10■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 213.04□□□□□ -0.324e-10■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 PIDD1-203ENST00000524486 3917 ntTSL 212.33□□□□□ -0.444e-10■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 PIDD1-210ENST00000534525 3994 ntTSL 212.18□□□□□ -0.464e-10■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 WEE1-203ENST00000524549 5187 ntTSL 27.09□□□□□ -1.271e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 COG4-202ENST00000393612 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.387e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 COG4-201ENST00000323786 2833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.587e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 COG4-203ENST00000482252 2953 ntTSL 210.75□□□□□ -0.697e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 PLOD3-211ENST00000466881 661 ntTSL 210.64□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 COG4-207ENST00000530314 3488 ntTSL 1 (best)10.52□□□□□ -0.727e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 COG4-205ENST00000526700 1978 ntTSL 510.03□□□□□ -0.87e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 COG4-211ENST00000564415 3000 ntTSL 59.77□□□□□ -0.857e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.326e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 CD81-216ENST00000531840 5235 ntTSL 1 (best)16.96■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 RPL7-203ENST00000396466 762 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.316e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 FLCN-204ENST00000389171 2523 ntTSL 215.78■□□□□ 0.128e-7■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.585e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 H2AFY-211ENST00000507868 861 ntTSL 221.72■■□□□ 1.075e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZFAND2B-219ENST00000486734 889 ntTSL 315.83■□□□□ 0.125e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 STARD10-217ENST00000543089 506 ntTSL 1 (best)15.48■□□□□ 0.075e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 STIP1-210ENST00000540887 877 ntTSL 214.09□□□□□ -0.155e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.195e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 STARD10-202ENST00000400925 541 ntTSL 212.44□□□□□ -0.425e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZFAND2B-213ENST00000448496 1064 ntTSL 312.42□□□□□ -0.425e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZFAND2B-209ENST00000422255 705 ntTSL 310.91□□□□□ -0.665e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 TNS3-203ENST00000415929 570 ntTSL 410.83□□□□□ -0.685e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 GTF3C2-201ENST00000264720 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.685e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 CLSTN3-206ENST00000535668 566 ntTSL 310.32□□□□□ -0.765e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 GTF3C2-206ENST00000454704 1440 ntTSL 1 (best)9.81□□□□□ -0.845e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 GTF3C2-207ENST00000457098 762 ntTSL 38.79□□□□□ -15e-20■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZFAND2B-216ENST00000469596 532 ntTSL 58.61□□□□□ -1.035e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 GTF3C2-213ENST00000495298 1064 ntTSL 28.52□□□□□ -1.055e-20■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 GTF3C2-202ENST00000359541 3992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.5□□□□□ -1.055e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.515e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 STIP1-202ENST00000355603 528 ntTSL 35.11□□□□□ -1.595e-12■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZNF638-222ENST00000491843 332 ntTSL 34.94□□□□□ -1.629e-15■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 GTF3C2-203ENST00000415683 779 ntTSL 54.65□□□□□ -1.675e-20■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 ZNF638-203ENST00000409544 6821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.815e-11■■■■■ 36.8
SF3B4Q15427 EIF1-206ENST00000586699 572 ntTSL 23.16□□□□□ -1.93e-31■■■■■ 36.8
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