Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 CAP1-201ENST00000340450 2592 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.89□□□□□ -1.151e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-212ENST00000424977 702 ntTSL 57.87□□□□□ -1.151e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 DHX35-201ENST00000252011 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.151e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-213ENST00000638402 1554 ntTSL 5 BASIC7.7□□□□□ -1.181e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CAP1-206ENST00000372805 2217 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.221e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-210ENST00000446330 1520 ntTSL 27.3□□□□□ -1.241e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-212ENST00000497935 666 ntTSL 27.23□□□□□ -1.251e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-211ENST00000446564 1177 ntTSL 27.13□□□□□ -1.271e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RABGAP1-209ENST00000475607 564 ntTSL 46.55□□□□□ -1.361e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RABGAP1-212ENST00000493854 575 ntTSL 46.52□□□□□ -1.371e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-205ENST00000447673 725 ntTSL 36.33□□□□□ -1.41e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 PTEN-202ENST00000462694 383 ntTSL 26.08□□□□□ -1.441e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-206ENST00000459683 744 ntTSL 25.89□□□□□ -1.471e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CHD9-217ENST00000565832 2169 ntTSL 1 (best)5.74□□□□□ -1.491e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.491e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SLC35F5-210ENST00000470204 523 ntTSL 55.36□□□□□ -1.551e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.621e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.661e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 NELFCD-210ENST00000490205 650 ntTSL 24.62□□□□□ -1.671e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 RABGAP1-205ENST00000456584 3897 ntTSL 24.33□□□□□ -1.721e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CHD9-209ENST00000564255 2896 ntTSL 53.2□□□□□ -1.91e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.921e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.991e-7■■■■□ 25.2
TARDBPQ13148 SF3B3-208ENST00000567250 1084 ntTSL 311.81□□□□□ -0.522e-12■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 SF3B3-211ENST00000568291 1067 ntTSL 29.54□□□□□ -0.882e-12■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 SF3B3-201ENST00000302516 9720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.212e-12■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 SF3B3-209ENST00000567635 630 ntTSL 56.95□□□□□ -1.32e-12■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 KLF6-203ENST00000461124 764 ntTSL 515.41■□□□□ 0.063e-9■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 KLF6-201ENST00000173785 925 ntTSL 213.03□□□□□ -0.323e-9■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 KLF6-206ENST00000497571 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.473e-9■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 KLF6-207ENST00000542957 4537 ntTSL 5 BASIC11.43□□□□□ -0.583e-9■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.21e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-209ENST00000574970 570 ntTSL 422.13■■□□□ 1.139e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-208ENST00000573784 559 ntTSL 419.18■□□□□ 0.669e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-212ENST00000590218 545 ntTSL 218.87■□□□□ 0.619e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-211ENST00000576984 544 ntTSL 417.93■□□□□ 0.469e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-207ENST00000573216 545 ntTSL 417.69■□□□□ 0.429e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-210ENST00000576925 611 ntTSL 217.69■□□□□ 0.429e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.399e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.239e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.229e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.119e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.119e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-213ENST00000613627 689 ntTSL 315.34■□□□□ 0.059e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-206ENST00000572899 582 ntTSL 215.12■□□□□ 0.019e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 09e-10■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 C21orf59-206ENST00000440966 1082 ntTSL 318.95■□□□□ 0.621e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 C21orf59-207ENST00000458138 863 ntTSL 317.7■□□□□ 0.421e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 C21orf59-202ENST00000300260 1243 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.321e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.221e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.341e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 AP000275.2-201ENST00000431216 891 ntAPPRIS P1 TSL 59.77□□□□□ -0.851e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 TBC1D20-203ENST00000461304 2024 ntTSL 1 (best)20.99■□□□□ 0.955e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.35e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 TBC1D20-204ENST00000494633 3820 ntTSL 213.19□□□□□ -0.35e-7■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 XRN2-201ENST00000377191 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -11e-6■■■■□ 25.1
TARDBPQ13148 KIF13A-206ENST00000502297 4009 ntTSL 57.08□□□□□ -1.285e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 CEP72-204ENST00000514507 897 ntTSL 313.77□□□□□ -0.211e-9■■■■□ 25
TARDBPQ13148 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.543e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 VAPA-205ENST00000578314 532 ntTSL 323.02■■□□□ 1.281e-10■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ASCC3-202ENST00000324723 852 ntTSL 316.48■□□□□ 0.232e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ASCC3-205ENST00000468245 1227 ntTSL 216.35■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.082e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.062e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.131e-13■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ASCC3-201ENST00000324696 3618 ntTSL 212.62□□□□□ -0.392e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ASCC3-203ENST00000369143 3433 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.42e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 MITF-216ENST00000495741 473 ntTSL 411.88□□□□□ -0.512e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ASCC3-204ENST00000369162 8146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 MITF-209ENST00000448226 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.882e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 MITF-207ENST00000429090 542 ntTSL 58.17□□□□□ -1.12e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 SEPT9-227ENST00000590059 670 ntTSL 520.14■□□□□ 0.812e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.472e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-205ENST00000415271 899 ntTSL 521.1■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-202ENST00000325997 2235 ntTSL 1 (best)19.29■□□□□ 0.681e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-211ENST00000470731 2251 ntTSL 1 (best)18.81■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-208ENST00000423395 543 ntTSL 517.05■□□□□ 0.321e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.211e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.181e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.171e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.171e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.221e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 SNX29-205ENST00000566228 8171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.733e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 SNX29-204ENST00000564791 1633 ntTSL 1 (best)10.4□□□□□ -0.753e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.712e-7■■■■□ 25
TARDBPQ13148 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.332e-6■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.68e-13■■■■□ 25
TARDBPQ13148 ZDHHC18-204ENST00000488397 1275 ntTSL 212.66□□□□□ -0.388e-13■■■■□ 25
TARDBPQ13148 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.234e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.234e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PABPC1-219ENST00000522387 2331 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.534e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PABPC1-224ENST00000610907 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.834e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PABPC1-209ENST00000519100 851 ntTSL 34.21□□□□□ -1.744e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PABPC1-212ENST00000519622 667 ntTSL 54.15□□□□□ -1.754e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 PABPC1-211ENST00000519596 771 ntTSL 32.93□□□□□ -1.944e-13■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 EXOC4-209ENST00000469115 755 ntTSL 37.04□□□□□ -1.287e-7■■■■□ 24.9
TARDBPQ13148 EXOC4-216ENST00000482089 628 ntTSL 46.98□□□□□ -1.297e-7■■■■□ 24.9
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