Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
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IFT88Q13099 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFT88Q13099 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
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