Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ERVFC1-1P60608 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms