Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
GSK3BP49841 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms