Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TM4SF4P48230 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TM4SF4P48230 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms