Protein–RNA interactions for Protein: P43355

MAGEA1, Melanoma-associated antigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA1P43355 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MAGEA1P43355 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MAGEA1P43355 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms