Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
CCNA2P20248 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
CCNA2P20248 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms