Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SYT7O43581 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SYT7O43581 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT7O43581 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT7O43581 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT7O43581 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT7O43581 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT7O43581 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SYT7O43581 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SYT7O43581 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms