Protein–RNA interactions for Protein: A8K830

COLCA2, Colorectal cancer-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLCA2A8K830 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
COLCA2A8K830 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
COLCA2A8K830 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms