Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ZNF316A6NFI3 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
ZNF316A6NFI3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.6 ms