Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PRELID3BQ9Y3B1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PRELID3BQ9Y3B1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms