Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX5

ITGA11, Integrin alpha-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA11Q9UKX5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ITGA11Q9UKX5 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ITGA11Q9UKX5 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms