Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN5

PRDM4, PR domain zinc finger protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM4Q9UKN5 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRDM4Q9UKN5 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRDM4Q9UKN5 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms