Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPUSD1Q9UJJ7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RPUSD1Q9UJJ7 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms