Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ1

COA4, Cytochrome c oxidase assembly factor 4 homolog, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COA4Q9NYJ1 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
COA4Q9NYJ1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
COA4Q9NYJ1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms