Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX47

MARCH5, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH5, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH5Q9NX47 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MARCH5Q9NX47 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MARCH5Q9NX47 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms