Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW68

BSDC1, BSD domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BSDC1Q9NW68 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
BSDC1Q9NW68 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
BSDC1Q9NW68 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms