Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TMEM30AQ9NV96 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TMEM30AQ9NV96 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms