Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2D6

TRIOBP, TRIO and F-actin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIOBPQ9H2D6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRIOBPQ9H2D6 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRIOBPQ9H2D6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms