Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0L4

CSTF2T, Cleavage stimulation factor subunit 2 tau variant, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF2TQ9H0L4 NEU4-212ENST00000435894 484 ntTSL 419.79■□□□□ 0.762e-9■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.538e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 214.98□□□□□ -0.011e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-214ENST00000574502 709 ntTSL 321.89■■□□□ 1.091e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.971e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-215ENST00000574888 509 ntTSL 419.98■□□□□ 0.791e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.661e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-206ENST00000570739 553 ntTSL 418.79■□□□□ 0.61e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.581e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.571e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-211ENST00000572497 432 ntTSL 417.67■□□□□ 0.421e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-205ENST00000570718 564 ntTSL 416.68■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-209ENST00000571791 851 ntTSL 216.68■□□□□ 0.261e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-217ENST00000575131 550 ntTSL 216.64■□□□□ 0.251e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-219ENST00000576235 991 ntTSL 515.53■□□□□ 0.081e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.051e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-213ENST00000573886 665 ntTSL 214.13□□□□□ -0.151e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.191e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-218ENST00000575877 1579 ntTSL 5 BASIC11.72□□□□□ -0.531e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ARRB2-208ENST00000571428 864 ntTSL 310.02□□□□□ -0.811e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ELF2-209ENST00000511184 1766 ntTSL 525.4■■□□□ 1.666e-8■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ELF2-208ENST00000511006 1434 ntTSL 1 (best)21.48■■□□□ 1.036e-8■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-226ENST00000589920 580 ntTSL 214.14□□□□□ -0.151e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 SEPT9-209ENST00000585638 565 ntTSL 413.16□□□□□ -0.31e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 CTIF-209ENST00000591387 859 ntTSL 216.96■□□□□ 0.312e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 CTIF-210ENST00000591412 491 ntTSL 312.52□□□□□ -0.412e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.974e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-212ENST00000600231 2534 ntTSL 219.52■□□□□ 0.714e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.174e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.064e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-213ENST00000603669 552 ntTSL 514.51□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-203ENST00000424536 808 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.344e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 GRAMD1A-204ENST00000594597 567 ntTSL 49.75□□□□□ -0.854e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.331e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 TSNARE1-203ENST00000518928 940 ntTSL 313.27□□□□□ -0.291e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0753-205ENST00000571642 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 48.64□□□□□ -1.032e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0753-201ENST00000361413 4859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.7□□□□□ -1.182e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0753-207ENST00000572370 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.22e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 KIAA0753-203ENST00000570455 447 ntTSL 56.5□□□□□ -1.372e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 HIVEP1-206ENST00000487103 585 ntTSL 28.99□□□□□ -0.973e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 HIVEP1-207ENST00000491710 579 ntTSL 38.81□□□□□ -13e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.995e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.353e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.944e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.354e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 PLPPR3-203ENST00000519502 782 ntTSL 223.16■■□□□ 1.34e-6■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 AFAP1-AS1-201ENST00000608442 6795 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.981e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 ZNF275-202ENST00000370251 6320 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.782e-7■■■■□ 21.6
CSTF2TQ9H0L4 KDM4B-210ENST00000592175 562 ntTSL 415.33■□□□□ 0.041e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 AC005394.1-201ENST00000589999 1269 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.921e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.391e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.251e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.187e-10■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 ARHGEF10-204ENST00000398564 5480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.562e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 ATP2A3-207ENST00000570773 989 ntTSL 213.55□□□□□ -0.242e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 ATP2A3-214ENST00000574999 776 ntTSL 312.39□□□□□ -0.432e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 ATP2A3-208ENST00000570845 604 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 ATP2A3-210ENST00000572116 429 ntTSL 1 (best)10.72□□□□□ -0.692e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.212e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.232e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 510.1□□□□□ -0.792e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.812e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 KDELR2-202ENST00000382267 583 ntTSL 49.16□□□□□ -0.942e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MSH6-206ENST00000455383 578 ntTSL 517.75■□□□□ 0.431e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MYADM-206ENST00000414489 592 ntTSL 513.27□□□□□ -0.291e-11■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.232e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.232e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.232e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.832e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MPC1-205ENST00000487218 918 ntTSL 59.1□□□□□ -0.952e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 MPC1-204ENST00000475708 651 ntTSL 52.37□□□□□ -2.032e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RPH3AL-219ENST00000576001 647 ntTSL 314.6□□□□□ -0.076e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-213ENST00000473238 568 ntTSL 317.91■□□□□ 0.463e-9■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.313e-9■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-206ENST00000438660 852 ntTSL 516.97■□□□□ 0.313e-9■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-205ENST00000429900 563 ntTSL 515.81■□□□□ 0.123e-9■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 WDR6-210ENST00000462064 589 ntTSL 514.33□□□□□ -0.123e-9■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 SPPL3-206ENST00000543181 663 ntTSL 37.05□□□□□ -1.281e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 EHBP1-203ENST00000405289 3591 ntTSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.272e-8■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.435e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 R3HDM4-205ENST00000589445 705 ntTSL 320.78■□□□□ 0.925e-7■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.575e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 RBM12-204ENST00000424458 1068 ntTSL 223.61■■□□□ 1.375e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-207ENST00000414664 1070 ntTSL 523.61■■□□□ 1.375e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-212ENST00000430570 1332 ntTSL 523.25■■□□□ 1.315e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-216ENST00000437340 1755 ntTSL 1 (best)23.09■■□□□ 1.295e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-205ENST00000401607 1795 ntTSL 522.81■■□□□ 1.245e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.245e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-217ENST00000439669 784 ntTSL 522.52■■□□□ 1.25e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-223ENST00000475146 627 ntTSL 322.52■■□□□ 1.25e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-220ENST00000458038 596 ntTSL 320.44■□□□□ 0.865e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-211ENST00000420363 821 ntTSL 219.93■□□□□ 0.785e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-219ENST00000440240 746 ntTSL 519.67■□□□□ 0.745e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-204ENST00000397443 1928 ntAPPRIS P1 TSL 519.27■□□□□ 0.685e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CSNK1G2-205ENST00000589385 896 ntTSL 517.48■□□□□ 0.394e-6■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-210ENST00000416778 744 ntTSL 216.82■□□□□ 0.285e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-213ENST00000434795 831 ntTSL 316.82■□□□□ 0.285e-12■■■■□ 21.5
CSTF2TQ9H0L4 CPNE1-224ENST00000483359 1975 ntTSL 516.46■□□□□ 0.235e-12■■■■□ 21.5
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