Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
PRAC1Q96KF2 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PRAC1Q96KF2 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms