Protein–RNA interactions for Protein: Q8N158

GPC2, Glypican-2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC2Q8N158 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GPC2Q8N158 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GPC2Q8N158 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms