Protein–RNA interactions for Protein: Q8IU54

IFNL1, Interferon lambda-1, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNL1Q8IU54 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IFNL1Q8IU54 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IFNL1Q8IU54 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms