Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SPECC1LQ69YQ0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SPECC1LQ69YQ0 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms